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PROXIMA-2A

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PROXIMA2A logo

Bienvenue à PROXIMA 2A !

Une lumière pour la biologie et la micro-cristallographie.

PX2-A wide-angle panorama phot

PROXIMA 2A (PX2-A) est une ligne de lumière micro-foyer-X dédiée à la bio-cristallographie et aux innovations méthodologiques pour les microfaisceaux-X. Ouvert depuis 2013, les sujets traités vont au delà de la cristallographie standard des protéines et incluent la découvert des médicaments, la résolution de protéines membranaires, la virologie, la cristallographie des petites molécules, la diffraction-X des poudres et même la cristallurie. La ligne de lumière est extrêmement automatisée et conçue pour aider les scientifiques à s’attaquer aux cibles structuraux et aux systèmes biologiques les plus exigeants. L’énergie des rayons-X est facilement accordable sur une grande gamme (6 – 18 keV) et rend la plupart des seuils d’absorption accessibles pour des expériences en diffraction-X anomale. La station expérimentale est équipée d’un passeur d’échantillon de haute capacité (148 ports d’échantillon du type SPINE), un goniomètre-kappa de haute performance, un détecteur de fluorescence-X (KETEK) et un grand détecteur-bidimensionnel rapide de faible bruit et compteur de photons unique - l’EIGER X 9M (dont 238 images par second en mode 9M ou 750 images par second en mode 4M).

Voir aussi Biologie Santé : HelioBio

L'équipe

SHEPARD
SHEPARD William
Responsable Ligne De Lumière
SAVKO
SAVKO Martin
Scientifique de Ligne De Lumière
SIRIGU
SIRIGU Serena
Scientifique de Ligne De Lumière
JEANGERARD
JEANGERARD Damien
PERL
PERL David
Duran Denis
Assistant Engineer
MEIJERS Rob
Beamline Scientist
SIMPKIN Adam
Thesard

Offres d'emploi

Contacter William SHEPARD pour plus d'information.

Données techniques

Energy range

6 - 18 keV

Energy Resolution

~0.0002 (Si 111)

Source

Onduleur "canted" U24 (4.5 mrad)

Flux @ first optical element

Faisceau blanc/rose

Optics

Monochromateur "channel-cut" refroidit par l'azôte liquide, (miroir convxe prefocalisant), miroirs focalisants en configuration Kirkpatrick-Baez.

Polarization

Linéaire

Detectors

EIGER X 9M area detector for X-ray diffraction images (238 fps in 9M mode, 750 fps in 4M mode)

Ketek SDD detector for X-ray fluorescence scans

Diamond scCVD and Ti foil XBPMs

High resolution X-ray camera (SOLEIL in-house design)

Thématiques scientifiques

Micro-crystallography

Small and weakly diffracting crystals

SAD and MAD phasing

Phasing with a range of heavy atoms, including sulphur

Plate screening

Screening of crystallization trays

En recherche interne à SOLEIL, la ligne de lumière PROXIMA-2A est rattachée à la section scientifique :

Section scientifique SOLEIL Biologie, santé, Héliobio

 

Avant de visiter PX2-A

Merci de contacter votre "Local Contact" avant votre session.

L'envoi des Dewars

Il y a DEUX moyens pour transporter les Dewars vers SOLEIL:

  • déposer/enlever à la main au Magasin de SOLEIL
    • pour les labos en Ile-de-France
  • livrer/enlever par un transporteur avec BORDEREAUX PRÉ-PAYÉS (DHL, FEDEX, UPS, etc...)
    • pour les labos françcais hors Ile-de-France
    • pour les labos hors France

Les transports des Dewars pouront etre prepayés par SOLEIL ou iNEXT Discovery (SOLEIL vous enverra les bordereaux prépayés):

  • pour les labos français hors Ile-de-France par SOLEIL jusqu'au trois (3) Dewars par session (que la session soit 1, 2 ou 3 shifts)
    • Contacter le User Office de SOLEIL (UserOffice@synchrotron-soleil.fr)
      • numero de projet SOLEIL (e.g. 20191234)
      • numero de la session (e.g. #3)
  • pour les labos hors France par iNEXT Discovery jusqu'un Dewar par session (que la session soit 1, 2 ou 3 shifts)
    • Contacter le User Office de SOLEIL (UserOffice@synchrotron-soleil.fr)
      • numero de projet SOLEIL (e.g. 20191234)
      • numero PID d'iNEXT (e.g. PID 13476)
      • numero de la session (e.g. #3)

Sinon, vous pourriez organiser le transport des Dewars vous meme.

En tout cas, il faut inclure DEUX (2) BORDEREAUX PRÉ-PAYÉS - UN ALLER et UN RETOUR.

Pour le REMOTE ACCESS, merci d'inclure une disque dur externe (HDD 1-2 To) avec votre Dewar.

Envoyez les Dewars aux Local Contacts (l'un des scientifiques ci-dessous):

  • Willima SHEPARD (Responsable ligne de lumière)
  • Serena SIRIGU
  • Martin SAVKO

Les numéros de téléphones de la ligne de lumière PROXIMA 2A (pour le transport des Dewars):

  • +33-1-6935-8180 (fixe)
  • +33-1-6935-8181 (sans-fils)

 

L'addresse de SOLEIL:

PROXIMA 2A
Synchrotron SOLEIL
L'Orme des Merisiers
Saint-Aubin, BP 48
91192 GIF-sur-YVETTE CEDEX
FRANCE

Merci de prevenir votre Local Contact, puisqu'il(elle) pourrait remplir votre Dewar avec de l'azôte liquide quand il arrive!

 

Types des echantillons

PROXIMA-2A prends tous les echantillons - les grands comme les petits! Et même les cristaux pas très beaux...

  • grand > 10 microns
  • petit < 10 microns
  • pas beau = fissuré, fracturé ou agglutinés, car souvent se sont des amas des micro-cristaux!

 
Types des port d'echantillons :

Robot CATS - Uniquement des pins du type SPINE dans des Uni-pucks

  • l'echangeur du CATS peuvent contenir jusqu'au neuf (9) uni-pucks, et chaque uni-puck peut contenir 16 SPINE pins, dont un total de 144 pins pour le grand Dewar du CATS sur PX2-A
    • Les pins SPINE sont disponibles chez Hampton, Mitegen & Molecular Dimensions
  • longueur du pin = 22 mm (du boucle au  base)
  • deplacement horizontale possible du goniometre  = -25 to +5 mm
     

Montage manuel

  • Le "mini-kappa" du goniometre peut etre incliné pour permettre un transfert facile sous cryogenie:
    • Mettez omega = 0° and kappa = 30 - 60°

- Un video expliquant le transfert des echantillons dans les fioles (vials) vers les Uni-pucks.

- Un video demontrant comment utiliser un "dry shipper" et comment recuperer les echantillons :

Pendant vos experiences

- Debut & fin pour les seesions sur PROXIMA-2A :

  • trois (3) shifts = 8h30  – 8h00 (le lendemain)
  • deux (2) shifts = 16h30 - 8h00 (le lendemain)
  • un (1) shift = 8h30 - 16h00

- L'equipement & accessories disponible aux utilisateurs:

  • Microscopes, pins SPINE, boucles & wands for fishing crystals
  • Materiel pour la cryogenie - azôte liquide, Dewars pour manupler les uni-pucks, cryo-tongs, gants, etc...
  • TOUS LES EQUIPEMENT DOIVENT RESTER SUR PROXIMA 2A!
     

- Les acquisitions des données sont faites via MXCuBE , voir le lien ci-dessous pour le guide (PX2-A MXCuBE Users Guide):

- Les fonctionalités

  • Verification de la position du faisceau-X (BeamCheck)
  • Transfert des echantillons (MOUNT & UNMOUNT)
  • Centrage des cristaux
  • Collectes des données cristallographiques
  • Changement de l'energie du faisceau-X
  • Spectra XFE et balayage d'energie
  • Collectes SAD & MAD
  • Collectes helicoidales
  • Balayages GRID et MESH

- Energies du faisceau-X disponibles

  • 6 – 18 keV
     

- Seuils d'absorption disponibles

  • K-edges Cr – Zr
  • L3-edges Ce - U
     

- Temps typiques des collectes

  • Minimum exposure time 4.2017 ms per frame (238 fps), nominal exposure time 4.5 ms per frame (222 fps)
  • 16.2 s per nominal data collection rate (4.5 ms par image, 0.1 degrees par image, 3600 images)
    • Attention: les 16.2 s n'inclus pas le mis en place du beamstop, movement du detecteur, ouverture de l'obturateur, etc...
  • Les parametres de default sont bien pour le plupart des cristaux

 

- Pour visualiser les images de diffraction-X

  • ALBULA
  • ADXV
     

- Traitement des images de diffraction-X

  • XDSME
  • autoPROC
     

- Horaires d'ouverture de la cantine

  • Lundi - Vendredi :
    • Petit dejeuner = 7:30 - 9:00 , 
    • Dejeuner = 11:45 - 13:45
    • Dîner = 19:00 - 21:00 (fermature 21:30)
  • Weekends (Samedis et Dimanches) & Jours de fetes :           
    • Petit dejeuner = 7:30 - 9:00  
    • Dejeuner = 12:30 - 13:30     
    • Dîner = 19:00 - 21:00 (fermature 21:30)

 

A la fin de vos experiences

- Recuperartion des données

  • Telecharger vos données sur une disque dur externe via un port USB3 ou USB2
  • Si possible, utiliser le script automatisé "altsync" (cntrl-C pour l'arreter et puis demounter le disque externe).
  • Uniquement les petites volumes des données (e.g. fichiers MTZ) peuvent etre telecharger chez vous via le systeme" SOLEIL Data Retrieval"

- Enlever l'echantillon du goniometre, enveler tous les uni-pucks et fermer les couvercles du CATS

- Signer le "Safety Approval Sheet"

Important:

  • Merci de nous dire vos reactions et remarques pour améliorer PROXIMA 2A!
  • Merci de nous envoyer des images, diaposatifs, publications de vos resultats!