PROXIMA-1

La section scientifique « Santé et bien-être » (Health & Well-Being ; HelioBio) de SOLEIL organisait le 1^er février 2023 dernier une journée de présentations de son activité et de discussions à destination des biologistes du plateau de Saclay, à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC, Gif sur Yvette). Retour sur cette journée.

La plus large et diverse famille d’enzymes du Vivant sont les enzymes dites à SAM radical. Elles catalysent un grand nombre de réactions biochimiques majeures souvent sans précédent dans le Vivant, notamment pour la biosynthèse d’antibiotiques ou de vitamines. Malgré leur importance, leur très large distribution dans le Vivant et leurs rôles biologiques-clés chez les bactéries mais également chez l’Homme, ces enzymes sont particulièrement difficiles à étudier car elles sont sensibles à l’oxygène et à la lumière.

Des chercheurs de la Fundación Instituto Leloir en Argentine et des lignes PROXIMA-1 et PROXIMA-2A à SOLEIL ont décrit, à l’échelle moléculaire, les changements de conformation déclenchés par un capteur de lumière présent dans la bactérie responsable de la pourriture noire chez les plantes crucifères. L'étude, publiée dans la revue "Science Advances", décrypte les mécanismes généraux qui sous-tendent la photoréception bactérienne et jette les bases du développement futur de stratégies contribuant au contrôle de ce parasite responsable de grandes pertes agricoles.

Divers hydrocarbures sont naturellement libérés dans les grands fonds marins, mais quelque chose les consomme directement dans les sédiments. Les responsables sont des micro-organismes spécifiques, capables de transformer ces hydrocarbures en dioxyde de carbone en l'absence d'oxygène. L'une de ces communautés microbiennes a récemment été échantillonnée dans les sédiments des grands fonds et son étude a montré que l’éthane était l’unique alcane utilisé par ces micro-organismes pour récupérer l’énergie nécessaire à leur survie.

Ce document, en anglais, que vous pouvez télécharger, présente l’avant-projet d'une mise à niveau des accélérateurs, des lignes de lumière et de l'infrastructure du Synchrotron SOLEIL (Conceptual Design Report ou CDR). Le projet est planifié en deux phases de 5 ans chacune, intitulées «construction» et «vers la pleine performance». 

Chez tous les organismes vivants, l’ADN génomique est composé de 4 bases nucléotidiques : A, T, C et G : adénine, thymine, cytosine et guanine. Tous, sauf chez certains bactériophages (virus qui infectent des bactéries) dont l’ADN est composé des 4 bases ZCGT ; l’adénine est remplacée par la diaminopurine, notée Z qui, comme l'adénine, se lie à la thymine, mais en formant avec elle 3 liaisons hydrogène au lieu de 2. 

Depuis 2017, le MOOC "Voyage au cœur du vivant avec les rayons X : la cristallographie", issu d’une collaboration entre le CEA, SOLEIL, et l’Ecole polytechnique, est accessible gratuitement sur le site de France Université Numérique (FUN). Découvrez à présent le livre "Introduction à la cristallographie biologique" (Editions EDP Sciences), auquel ont participé deux scientifiques de SOLEIL, déjà impliqués dans le MOOC.

Le fonctionnement de l’enzyme FAP (Fatty Acid Photodecarboxylase), utile pour produire des biocarburants et de la chimie verte, a été décrypté. Ce résultat a mobilisé une équipe internationale de scientifiques, dont de nombreux chercheurs français du CEA, du CNRS, de l’Inserm, de l’École Polytechnique, des universités de Grenoble Alpes, Paris-Saclay et Aix-Marseille, ainsi que de l'ESRF et de la ligne PROXIMA-1 de SOLEIL. Cette découverte est publiée dans Science le 09/04/2021.