Biologie, santé

Voyage au cœur du vivant avec les rayons X : la cristallographie

Les installations expérimentales d’un centre de rayonnement synchrotron s’appellent des « lignes de lumière ». Il s’agit d’un ensemble de cabanes successives où le rayonnement est recueilli, sélectionné, focalisé et dirigé vers les échantillons à étudier. 

Grâce à l’utilisation des lignes PROXIMA-1 et PROXIMA-2A, des chercheurs de l’Ecole Polytechnique (CNRS, Palaiseau) et de l’IGBMC (CNRS, INSERM et Université de Strasbourg) ont déterminé la structure d’un complexe de protéines : l’enzyme Dcp2, associée à ses deux « molécules d’assistance », les cofacteurs Dcp1 et Edc3. La structure de ce complexe a par ailleurs permis de révéler le mécanisme d’action de Dcp2, impliquée dans l’élimination de la coiffe des ARN messagers (ARNm), une réaction essentielle à la dégradation des ARNm au cours de la synthèse des protéines.

Un travail de recherche sur la génération de cristaux naturels de protéines par une espèce vivipare de cafards a été effectué en partie sur la ligne PROXIMA-1.

Des études de microscopie de fluorescence UV menées par des chercheurs de l’INRA sur la ligne DISCO ont permis d’étudier au niveau cellulaire l’absorption d’huile dans des tranches de pommes de terre frites (voir cette actualité), en permettant notamment de visualiser le trajet suivi par l’huile lorsqu’elle entre en contact avec les tranches de pomme de terre.

La structure du site de fixation anticorps/virus a été résolue grâce à des données obtenues sur les lignes PROXIMA-1 et PROXIMA-2A

Une nouvelle étape vers un diagnostic plus précis des dysfonctionnements rénaux graves ou sévères vient d’être franchie. Dans une récente étude publiée dans Comptes Rendus Chimie, des scientifiques ont combiné la microscopie électronique à balayage à effet de champ, la fluorescence dans l’UV profond, la spectroscopie Raman et les techniques classique et synchrotron de spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier pour s’intéresser aux biopsies rénales contenant des cristaux.

Des chercheurs de l’Université de Belgrade ont réussi à démontrer l’utilité de l’utilisation  d’une nanoparticule d’or fonctionnalisée par le tryptophane comme sonde fluorescente pour l’imagerie ans les cellules microbiennes. Dans cette étude, publiée dans la revue Colloids and Surfaces B: Biointerfaces, la distribution spatiale de cet hybride a pu être déterminée dans une cellule individuelle d’E. coli en imagerie dans l’ultraviolet profond, technique à haute résolution spatiale.

Le groupe du Dr. Stefan Arold de KAUST en Arabie Saoudite est devenu le premier groupe à résoudre la structure d'une protéine importante en utilisant le nouveau détecteur EIGER 9M à SOLEIL.

Caractérisation de l’équilibre entre l’acide acétique et son dimère

L’énergie libre de dimérisation de l’acide acétique à température ambiante a été déterminée par une méthode d’analyse basée exclusivement sur la spectroscopie infrarouge, levant ainsi la controverse sur la capacité de cette technique à produire des données thermodynamiques de qualité.